Segundo a Comissão de Química e Fertilidade do Solo dos estados do RS e SC (CQFS-RS/SC, 2004), a recomendação para a implantação do SPD a partir de área cultivada sob SCC, é fazer uma amostragem de solo na camada de 0-20 cm e aplicar a quantidade de calcário necessária para elevar o pH do solo a 6,0, seguido de incorporação no solo. A partir dessa última operação de incorporação as amostras devem ser coletadas somente na camada de 0-10 cm e a aplicação do calcário é feita, quando necessária, superficialmente e sem incorporação. Contudo, nos estados do RS e SC, muitos agricultores negligenciaram essa recomendação e começaram a cultivar o solo no SPD em áreas degradadas quimicamente sem fazer essa correção prévia do solo em profundidade antes da implantação do SPD.

Devido à baixa mobilidade do calcário em profundidade, os efeitos benéficos da correção da acidez do solo que recebe calcário superficialmente se estendem somente aos primeiros centímetros de solo (geralmente até 10 a 12 cm). Por isso muitas dessas áreas possuem problemas severos de toxidez de alumínio em camadas mais profundas do solo (10-20 cm), que impedem o aprofundamento do sistema radicular das plantas. Isso significa que as plantas cultivadas nessas áreas, sejam elas pastagens ou culturas anuais, não conseguem acessar água e nutrientes do solo em camadas mais profundas, resultando em produtividade limitada, especialmente em períodos de estiagem.

Por isso, é de extrema importância que nas áreas cultivadas onde verifica-se crescimento radicular limitado das plantas, seja coletado amostras de solo na camada de 10-20 cm, além do solo da camada 0-10 cm. Em áreas com pH do solo da camada 10-20 cm abaixo de 5,5, com elevada saturação por alumínio (maior que 30%), e baixa saturação por bases (menor que 65%), deve-se levar em consideração uma possível calagem com incorporação para corrigir toda a camada de 0-20 cm e então retomar um SPD com maior qualidade e produtividade.